内核版本差异。Protel99是一个过渡版本，其内部版本仍为3.0，即Protel98，只不过将其用Access数据库进行封装，集成到一个DDB文件之内。Protel99SE的内核是4.0的。SP6是最终版本，比较完善。注意Protel99不能打开Protel99SE创建的DDB文档中的PCB、Sch等文档，反之而可以。
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